Protein–RNA interactions for Protein: Q16625

OCLN, Occludin, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCLNQ16625 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OCLNQ16625 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms