Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTF1Q16619 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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CTF1Q16619 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTF1Q16619 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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