Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NREPQ16612 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NREPQ16612 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NREPQ16612 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms