Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIK5Q16478 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIK5Q16478 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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