Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC6Q16204 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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