Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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