Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3CQ15386 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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