Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF4Q15306 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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IRF4Q15306 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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