Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms