Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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LAPTM4AQ15012 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms