Protein–RNA interactions for Protein: Q14CS0

UBXN2B, UBX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2BQ14CS0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN2BQ14CS0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN2BQ14CS0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms