Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB39AQ14964 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB39AQ14964 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms