Protein–RNA interactions for Protein: Q14181

POLA2, DNA polymerase alpha subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA2Q14181 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLA2Q14181 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms