Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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