Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms