Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCOF1Q13428 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
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TCOF1Q13428 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCOF1Q13428 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
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