Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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