Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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