Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PMS2P3Q13401 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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