Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIGQ13278 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIGQ13278 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIGQ13278 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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