Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGDRQ13258 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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PTGDRQ13258 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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PTGDRQ13258 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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PTGDRQ13258 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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