Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSPB3Q12988 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSPB3Q12988 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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