Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BNIP3Q12983 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms