Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXF2Q12947 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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