Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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