Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD3Q0VAK6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMOD3Q0VAK6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms