Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCBP1Q09161 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms