Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4CQ08493 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms