Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBQ06643 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBQ06643 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBQ06643 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBQ06643 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBQ06643 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBQ06643 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBQ06643 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBQ06643 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms