Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
RAD51Q06609 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms