Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCZQ05513 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCZQ05513 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms