Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms