Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLH2Q02577 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms