Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms