Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD3P84022 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms