Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VBP1P61758 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VBP1P61758 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VBP1P61758 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VBP1P61758 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VBP1P61758 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VBP1P61758 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VBP1P61758 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VBP1P61758 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VBP1P61758 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VBP1P61758 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VBP1P61758 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VBP1P61758 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms