Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms