Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms