Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms