Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FXYD4P59646 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms