Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP107P57740 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP107P57740 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP107P57740 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUP107P57740 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NUP107P57740 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP107P57740 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms