Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLF3P57682 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF3P57682 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLF3P57682 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLF3P57682 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLF3P57682 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF3P57682 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms