Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIPPLY3P57055 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms