Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms