Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP1B3P54709 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms