Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP12AP54707 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms