Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKAA2P54646 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms