Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA8P53708 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms