Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP98P52948 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP98P52948 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP98P52948 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP98P52948 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP98P52948 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP98P52948 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP98P52948 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP98P52948 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP98P52948 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP98P52948 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP98P52948 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP98P52948 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP98P52948 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP98P52948 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP98P52948 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP98P52948 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP98P52948 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms