Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLK1P49759 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLK1P49759 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms